以前ドロイドに侵略を受けたナブーに、再びドロイドの数が増えていた。ニーユートニー女王は再び侵略が起こると危惧するが、パドメはさらなる証拠を集めるべきだと考える。ドロイドの残骸からパーロートの木の近くに秘密研究所があると確信したパドメは調査に赴くが、ドクター・ヌーヴォ・ヴィンディに捕まってしまう。ドクターはかつて絶滅したブルー・シャドー・ウイルスを復活させ、さらに水中だけではなく空中でも感染するように作り替えた。パドメ救出とウイルス拡散防止のため、アナキンらは研究所へ向かう。
片っ端の星からウイルス爆弾を落とすという発想、なかなかのマッドサイエンティストです。