夏休み最後の日、宿題に追われる当麻は相変わらずマイペースなインデックスに振り回される。さらに、インデックスの力を狙う謎の男も現れ、宿題はぐちゃぐちゃに……。 待望の第2期スタートで、第1期はちゃんと見ていたけれど超電磁砲を見ていない自分は大丈夫…