メイジャーランドで歌の妖精ハミィが伝説の楽譜で幸せのメロディを奏でようとしたその瞬間、マイナーランドの王・メフィストが楽譜を奪いに現れた。女王アフロディテはメフィストから楽譜を守るため、音符を人間界へとばらまいてしまう。ハミィと、マイナーランドのセイレーンは音符を集めるため、人間界へと赴く。
一方、人間界では北条響と南野奏が今日もいつも通りケンカを繰り広げていた。そんな二人の前にセイレーンが現れ、奏の持っていた大事なレコードをネガトーンに変えてしまった。これに怒った二人は、伝説の戦士プリキュアに変身する。
導入編としては別段変わったところのない第1話。二人が第1話で同時に変身する、というのは「ふたりはプリキュア」っぽくていいなぁ。セイレーンは敵の立場を貫けるんだろうか。